Khi mới thành lập (8/4/1993), Trung tâm chỉ có 05 cán bộ từ các phòng/ban khác trong Sở chuyển sang, trong điều kiện khó khăn thiếu thốn về cơ sở vật chất, nhưng bằng ý chí vươn lên, bằng sự năng động sáng tạo cùng với lòng nhiệt huyết, chỉ trong thời gian ngắn Trung tâm đã từng bước xây dựng cơ sở vật chất bằng nguồn vốn tự có của đơn vị, tuyển dụng và đào tạo nguồn nhân lực đáp ứng yêu cầu của khách hàng trong việc thực hiện các dịch vụ hỗ trợ kỹ thuật an toàn.

Tháng 3 năm 1999, Trung tâm bổ sung thêm chức năng kiểm định kỹ thuật an toàn các loại máy, thiết bị có yêu cầu nghiêm ngặt về an toàn lao động và đổi tên thành Trung tâm Kiểm định và Huấn luyện Kỹ thuật An toàn Lao động Thành phố Hồ Chí Minh.

Điểm nổi bật của giai đoạn này là chức năng và phạm vi hoạt động của Trung tâm ngày càng được mở rộng:
• Năm 2010, bổ sung thêm chức năng kiểm tra chất lượng sản phẩm hàng hóa.
• Năm 2011, bổ sung chức năng kiểm định đồng hồ đo áp suất.
• Năm 2013, bổ sung chức năng đo, kiểm, báo cáo giám sát môi trường lao động công nghiệp.
• Năm 2016, bổ sung chức năng chứng nhận sự phù hợp.

Để tạo điều kiện cho sự phát triển không ngừng của đơn vị, ngày 20/6/2017, UBND Thành phố Hồ Chí Minh đã ký quyết định tổ chức lại Viện Khoa học An toàn Vệ sinh lao động TP.HCM với nhiều chức năng mới